Фонд «Документы до 1917 года» насчитывает 25575 единиц хранения. Основу фонда составляют архивы ликвидированных учреждений, обществ – Музея древностей, Новгородского общества любителей древностей, Новгородской губернской ученой архивной комиссии, Новгородского церковно-археологического общества, Новгородского архиерейского дома и Духовных правлений, Новгородской духовной консистории, Новгородских духовных учебных заведений; архивы закрытых – Софийского и Знаменского соборов; Деревяницкого Воскресенского, Кирилло-Новоезерского, Ионо-Отенского, Антониева, Воскресенского Мячинского, Юрьева, Вяжищского, Кириллова, Сыркова, Леохновского, Савво-Вишерского, Варлаамо-Хутынского, Свято-Духова, Спасо-Нередицкого, Старорусского Успенского монастырей; церквей Покрова в Кремле, Успения в с. Курицко, Благовещения на Мячине; национализированных помещичьих усадеб – Багратион-Мухранских, Дириных, Кожевниковых, Колюбакиных, Лутовиновых, Линевых, Фроловских; государственных и церковных деятелей – А.А. Аракчеева, генерала от артиллерии, В.А. Цеэ, сенатора, Арсения (А.Г. Стадницкого), митрополита, Арсения (А.И. Иващенко), епископа, Антония (Знаменского), архиепископа; краеведов – В.С. и В.В. Передольских, Н.Г. Богословского, И.А. Аничкова, М.И. Никольского; педагогов, литераторов – В.П. Острогорского, И.С. и М.Д. Соколовых; полковника 85 выборгского полка Л.Е. Рущевского; создателя первого в России частного музея Л.Н. Толстого и последователя его учения В.А. Молочникова.

Из отдельных разрозненных документов составлены тематические коллекции: древнерусских грамот из Новгородских губернских и уездных административных и судебных учреждений и личных архивов (1611-1715 гг.); манифестов, указов, рескриптов, приказов и др. распоряжений и объявлений верховной и местной власти (1720-1917 гг.); ведомостей, описей и описаний соборов и церквей Новгородской епархии (1748-1914 гг.) и др.

Однако самые ранние документы фонда – грамота великого князя Мстислава и сына его Всеволода новгородскому Юрьеву монастырю (1130 г.) и грамота Варлаама Хутынскому монастырю (1192 г.). Это древнейшие русские пергаменные грамоты, предмет особой гордости Новгородского музея.

К концу XVI-XVII вв. относятся столбцы – источники об имущественно-хозяйственной деятельности церквей, монастырей и органов церковного управления новгородской епархии. Информативную ценность представляют писцовые книги.     Собрание источников XVII в. дополняют грамоты: жалованные, правые, вкладные, благословенные, ставленые и др.

Еще одну группу исторических источников составляют описи (инвентарные книги) соборов и церквей, в которых в течение XVIII–XIX вв. регистрировалось имущество отдельного храма. Они дают полную информацию о количественном состоянии церковного имущества, его утратах и пополнениях. В описях заложен обширный материал по истории храма, его архитектуре и строительстве, накоплению архива и формированию библиотеки, топографии некрополя и хранении реликвий.

В составе фонда – автографы известных в нашей стране лиц: императора Петра I, императрицы Екатерины I, царевича Алексея Петровича, цариц Прасковьи Федоровны и Екатерины II, светлейшего князя А.Д. Меньшикова, царя Александра I; русского политического деятеля, историка, публициста П.Н. Милюкова; русского юриста и общественного деятеля, члена Государственного Совета, почетного академика Петербургской АН А.Ф. Кони; председателя Московского археологического общества  графини П.С. Уваровой, русских художников В.М. Максимова, М. Клодта; русских поэтов, писателей и журналистов – А.А. Вербицкой, И.И. Лажечникова, А.П. Чехова, К. Бальмонта, М.А. Кузмина, С.Р. Минцлова; деятелей сценического искусства – В.П. Веригиной, А.А. Яблочкиной, В. Немировича-Данченко; бабушки композитора С.В. Рахманинова С.А. Бутаковой; известных деятелей в истории русской церкви, архимандрита новгородского Юрьева монастыря в 1822-1838 гг. Фотия (Спасского), викария новгородского Алексия (Симанского), с 1945 г. Патриарха Московского и всея Руси и  др.